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3) Installation locale

Sous Ubuntu/Debian:

  1. Installation des paquets perl5 requis :

  1.  
  2. sudo apt install bison, libappconfig-perl, libipc-run-perl
  1. Il vaut mieux commencer par installer anaconda et exécuter ./alpi dans un environnement, par ex:

<span style="color: #c20cb9; font-weight: bold;">(base) <a href="mailto:user@host">user@host</a>:/path_to_alpi$ perl</span> .<span style="color: #000000; font-weight: bold;">/</span>alpi

  1. syntax error at ./alpi line 1022, near "CONDA_CHANNEL"

Lignes 1021 et 1022, ajouter une virgule en fin de ligne :

CONDA => 'perl-appconfig',
CONDA_CHANNEL => 'bioconda',
  1. Bareword "CONDA" not allowed while "strict subs" in use at ./alpi line 1945.
if ($self->(CONDA)){

=>

if ($self->{CONDA}){

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